6月11日（土）、ベイコム野球場で行われた関西地区大学二次トーナメント準決勝は、立命館大学と近畿大学がそれぞれ勝利し、25日（土）の決勝戦で全日本選手権大会出場権を掛けて戦うことになった。
準決勝で惜しくも敗れた、兵庫教育大学と大阪経済大学は、9月に浜松で行われる清瀬杯全日本大学選抜大会に関西地区代表で出場する。
第1試合
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 計 | |
| 立命館大学 | 0 | 0 | 0 | 6 | 0 | 3 | 0 | 9 | ||
| 兵庫教育大学 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| (7回コールドゲーム) | ||
| (立命館) | 酒井・本郷・鐘ヶ江 ー 中小路 | |
| (兵庫教育) | 中川・戸川・佐々木 ー 中里 | |
| [本塁打] | 中小路（立命館） | |
| [三塁打] | 陰山（兵庫教育） | |
| [二塁打] | 中小路・藤原（立命館） | |
第2試合
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 計 | |
| 近畿大学 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 2 |
| 大阪経済大学 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 |
| (近畿大) | 三木・欅谷・小川 ー 南 | |
| (大阪経済大) | 木村・千葉・石田 ー 岩崎 | |
| [本塁打] | ||
| [三塁打] | 若間・松下（近畿大） | |
| [二塁打] | 岩崎（大経大） | |
【決勝戦＆第5代表決定戦】
月日 6月25日（土）
場所 伊丹スポーツセンター野球場
決勝戦（10：00） 立命館大学 対 近畿大学
第5代表決定戦（13：30） 京都府立医科大学 対 トーナメント2位校
【組合せ】
160611_Tournament_2nd